Pembersihan ialah langkah asas dalam menyelenggara kabinet pemfailan, dan kaedah berbeza-beza bergantung pada bahan. Untuk kabinet pemfailan logam, gunakan kain lembut dan kering untuk mengelap habuk permukaan. Jika terdapat kotoran, lembapkan kain lembut dengan detergen yang dicairkan, lembut, neutral dan lap perlahan-lahan; elakkan pembersih berasid, beralkali atau menghakis, kerana ini boleh merosakkan kemasan. Selepas pembersihan, lap sebarang lembapan dengan kain kering untuk mengelakkan karat yang disebabkan oleh sisa air.
Membersihkan kabinet pemfailan kayu memerlukan perhatian yang teliti terhadap kawalan kelembapan. Untuk pembersihan rutin, lap permukaan dengan kain lembut yang sedikit lembap dan segera keringkan dengan kain kering. Elakkan daripada membenarkan kelembapan berlebihan meresap ke dalam kayu, yang boleh menyebabkan meledingkan atau retak. Untuk kabinet kayu bervenir atau lacquer, jangan gunakan pengilat-berasaskan lilin, kerana ini boleh menyebabkan permukaan melekit atau merosakkan kemasan.
Apabila membersihkan kabinet pemfailan dengan pintu kaca, gunakan pembersih kaca khusus dan elakkan menggunakan alat keras yang boleh mencalarkan permukaan kaca. Kendalikan pintu perlahan-lahan semasa membuka dan menutup untuk mengelakkan kaca daripada pecah akibat hentaman.